Die Trägerin der Schule ist die Evangelisch-lutherische Landeskirche Hannovers, die zuständige Dezernentin für das Schulwesen ist Oberlandeskirchenrätin Dr. Kerstin Gäfgen-Track.
Die Begleitung und Verwaltung der Schulen übernimmt innerhalb der Kirche das Evangelische Schulwerk.
Ziel der Arbeit des Schulwerkes ist es, Bildung und Erziehung in evangelischer Verantwortung durch evangelische Schulen wahrzunehmen, die Zusammenarbeit evangelischer Schulen untereinander zu stärken und das Profil evangelischer Schulen zu schärfen.
Das Schulwerk sorgt für die Ausstattung der Schule und ist auch Ansprechpartner für Fragen rund ums Schulgeld. Ein Mitarbeiter des Schulwerks, Thomas Hahn, hat seinen Dienstsitz im Verwaltungsgebäude der Schule, so dass die Zusammenarbeit in der Verwaltung auf kurzen Wegen geschieht.
Für die Paul-Gerhardt-Schule ist eine Verfassung und eine Schulgeldordnung beschlossen worden.